FFU风机过滤单元设计数量按照净化要求的换气次数进行计算。由于洁净冷库对制冷有要求，总风量要求会大于普通该级净化区域的要求，同时考虑到冷库温度的均匀性与可靠性，采用FFU满布率达到60%以后，使房间气流达到层流的要求。
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在已经高度洁净的药厂净化车间内，为了保持药品生产洁净车间的卫生，操作人员还会利用气流气压来打造一个缓冲间，保护洁净车间的洁净环境。这个缓冲间位于洁净车间和走廊之间，往往会有单扇和双扇门，单扇门用于行走人员，双扇门用于运输物料，人物分开。而这个缓冲间的气压要略高于两边的洁净室和走廊，且通往洁净室和走廊的门不可以同时打开。这样，在气压不对等的情况下，走廊的空气和洁净室的空气因为气压较低，就不会进入气压较高的缓冲间内，这样中间高两边低的设计避免了双方空气的交叉污染。
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有些药厂净化车间在空态或静态测试洁净度时，勉强合格，在动态测试（生产）条件下，昆明药品车间净化工程，洁净度不理想；所以不得不把空调机组变频调速设置为Max工况（如此换气次数即达到相对值），以使室内洁净度达到要求。换气次数的增加势必会导致能耗加大，形成不必要的支出，加大了药品的生产成本。
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