3.滤膜法
滤膜法是当样品中菌数很低时，可将一定体积的湖水、海水或饮用水灯样品通过膜过滤器。然后将滤膜干燥、染色，药品微生物限度，并经处理使膜透明，再在显微镜下计算膜上(或一定面积上)的细菌数。
此法也可以通过培养观察形成的菌落数来推算样品中的菌数。例如测定饮用水中大肠gan菌的数目:将已知体积的水过滤后，将滤膜放在伊红美蓝培养基上培养。在该培养基上大肠gan菌的菌落呈现黑色，可根据培养基上黑色菌落的数目，计算出水样中大肠gan菌的数目。
此法也是统计样品中活菌的数目。
4.比浊法
原理是在一定范围内，菌是悬液中细胞浓度与混浊度成正比，即与光密度成正比，菌越多，光密度越大。因此可借助与分光光度计，在一定波长下，测定菌悬液的光密度，以光密度表示菌量。实验测量时一定要控制在菌浓度与光密度成正比的线性范围内，否则不准确。
5.显微镜直接计数法
在课本生物选修1生物技术实践P22中“除了上述活菌计数法外，显微镜直接计数也是测定微生物数量的常用方法。”这里说的显微镜直接计数，我认为应该是在稀释涂布的基础上不培养成菌落而通过染色的方法在显微镜下直接计数。再如滤膜法也一样，可以有两种情况。
另外，微生物计数法发展迅速，多种多样的快速、简易、自动化的仪器和装置等方法可以用来统计微生物的数目。
微生物限度检查
（2）薄膜过滤法 薄膜过滤法所采用的滤膜孔径应不大于0.45μm，直径一般为50mm，工作台微生物限度，若采用其他直径的滤膜，微生物限度，冲洗量应进行相应的调整。供试品及其溶剂应不影响滤膜材质对微生物的截留。滤器及滤膜使用前应采用适宜的方法灭菌。使用时，应保证滤膜在过滤前后的完整性。水溶性供试液过滤前先将少量的冲洗液过滤以润湿滤膜。油类供试品，其滤膜和滤器在使用前应充分干燥。为发挥滤膜的da过滤效率，应注意保持供试品溶液及冲洗液覆盖整个滤膜表面。供试液经薄膜过滤后，若需要用冲洗液冲洗滤膜，每张滤膜每次冲洗量一般为100ml。总冲洗量不得超过1000ml，以避免滤膜上的微生物受损伤。
取照上述“供试液的制备” “接种和稀释” 和“抗jun活性的去除或灭活” 制备的供试液适量（一般取相当于1g、1ml或10c㎡的供试品，若供试品中所含的菌数较多时，供试液可酌情减量），加至适量的稀释液中，混匀，过滤。用适量的冲洗液冲洗滤膜。
若测定需氧菌总数，转移滤膜菌面朝上贴于胰酪大豆胨琼脂培养基平板上；若测定霉菌和酵母总数，转移滤膜菌面朝上贴于沙氏葡萄糖琼脂培养基平板上。按表1规定条件培养、计数。每株试验菌每种培养基至少制备一张滤膜。同法测定供试品对照组及菌液对照组菌数。
菌落总数测定注意事项
1.选取样品要有代表性，如为固体样品要多采几个部位，液体检样要混匀。
2.每次做样从开始到结束都要进行超净台空气净度的监测，同时对所有灭菌物品做空白对照。
3.为减少稀释倍数的误差，在做连续递增稀释时，每一稀释液应充分振摇使其均匀，同时每一稀释度换一支吸管。
4.在进行连续稀释时，空气微生物限度，应将吸管内液体沿壁流入，勿使吸管触及稀释液。
5.倾倒营养琼脂培养基平板时，温度要在46±1℃之间，数量要在15ml左右为宜，不要太多太少。
6.培养物48h培养后培养基失重不超过15%，培养箱内要放水。
7.样加入平皿后应立即倾注培养基并旋转混匀，一般从稀释到倾注不超过20分钟。
8.平皿内如有链状菌落生长时：菌落之间无明显界限且仅有一条链可视为一个菌落，如为不同来源的几条链则将每条链各做一个菌落记。
9.做菌落记数时平板里所有的菌落都要记数。
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