洁净厂房建筑方式可分为土建结构和装配式两种，洁净车间设计，其中普遍采用装配式。装配式洁净厂房系统主要由初，洁净车间装修，中，高三级空气过滤的空调送风回风和 排风系统；动力及照明系统；工作环境参数的监测报警消防和通讯系统；物流系统；工艺管路系统；维护结构及静电地面处理等各方面所要求的实施内容组成，形成空调净化系统工程所包含的整个设备和器材的配套和建筑安装内容。
洁净厂房施工过程中应采取以下措施
（1）对关键部位宜进行样板制施工，待业主和监理工程师认可后大规模施工。
（2）管道、设备等安装及调试应在建筑装饰装修工程施工前完成，当不能提前时，洁净车间，应在饰面等施工前完成。
（3）应及时填写施工检查记录和施工验收记录以及其他应予填报的记录，做到文件与工程同步。
（4）对于特殊制作工序，必须制定特殊工序规定，洁净车间设计规划，施工人员应熟练掌握特殊工序的规定。
（5）对环境有要求的施工工序，应确保环境要求后，方可施工。
洁净厂房的施工安装需多工种密切配合，按具体工程实际情况，制定施工安装程序和计划进度，循环渐进地完成洁净厂房的施工建造。
洁净厂房装饰装修工程的施工应在厂房主体结构和屋面工程完成并验收合格后进行。对现有建筑进行洁净室装饰装修时，应对现场环境、现有设施等进行清理与清洁，达到洁净施工要求后才能进行具体的施工。
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