病菌靠分生孢子或子囊孢子借气流传播到感病小麦叶片上，遇有温湿度条件适宜，病菌萌发长出芽管，芽管前端膨大形成附着胞和侵入丝，穿透叶片角质层，侵入表皮细胞，形成初生吸器，并向寄主体外长出菌丝，后在菌丝丛中产生分生孢子梗和分生孢子，成熟后脱落，随气流传播蔓延，进行多次再侵染。病菌在发育后期进行有性繁殖，在菌丛上形成闭囊壳。该病菌可以分生孢子阶段在夏季气温较低地区的自生麦苗或夏播小麦上侵染繁殖或以潜育状态渡过夏季，也可通过病残体上的闭囊壳在干燥和低温条件下越夏。
菜瓜蔓枯病在田间主要发生在茎蔓上，致蔓枯死，但也能为害幼苗，茎部及果实，近地面的茎，初染病时，仅病班与健全组织交界处呈水浸状，病情扩展后，组织坏死或流胶，在病部出现许多黑色小粒点，严重时整株；叶片染病，呈水浸状黄化坏死，严重整叶枯死；果实染病，产生黑色凹陷斑，龟裂或致果实。病菌以子囊壳、分生孢子器、菌丝体潜伏在病残组织上留在土壤中越冬，翌年产生分生孢子进行初侵染。植株染病后释放出的分生孢子借风雨传播，进行再侵染。
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