甜瓜枯萎病是典型的土传真菌病害，典型症状是萎蔫。在植株整个生育期均可发生，但以开花坐果期发病重，常引起瓜秧枯萎。出苗期发病，幼苗茎基部变褐缢缩，下部叶片变黄猝倒而死，剥开病部放大观察，可见幼嫩组织变淡褐色；苗期发病，叶色变浅，逐渐萎蔫，严重时幼苗僵化枯死；成株期发病初期，叶片由基部向顶部逐渐萎蔫，似缺水状，晴天中午更为明显，傍晚逐渐恢复，叶面不产生病斑，数日后，瓜秧叶片萎蔫下垂，病株茎基部表现矮缩，表皮粗糙、纵裂。
内部症状因属于维管束病害，内部症状很明显。在中柱髓部及周围，有黄红色病变的维管束，成斑点状或线条状，越近茎基部病变颜色越深，烤烟炭疽病能治好吗，根部木质导管变为红棕色，并逐渐变成黑褐色而干枯。球茎变成黑褐色并逐渐腐烂，有特殊臭味。
病原菌是真菌，尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum f. sp.）。产生两种类型的分生孢子。大型分生孢子镰刀形，3～5个分隔，多数3个分隔；小型分生孢子单胞或双胞，卵形或圆形。菌核暗黑色，直径O．5～1毫米，大达4毫米。原膜孢子椭圆形至球形。此菌有4个生理小种， 以古巴生理小种 4号为严重；大密哈(AAA)对1号小种十分感病，但抗2号小种；勃拉戈(ABB)相对感2号小种；但抗1号小种；3号小种只侵害羯尾蕉；矮把香芽蕉原是抗病品种，但1976年在台湾出现4号小种，造成严重损失。
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