辣椒枯萎病的病原为尖孢镰刀菌（学名：Fusarium oxysporum），属半知菌类、从梗孢目、瘤座孢科、镰刀菌属真菌。已报道的有2种致病专化型，即尖孢镰刀菌萎蔫专化型（学名：Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum）和尖孢镰刀菌辣椒专化型（学名：Fusarium oxysporum f. sp. capsicum）。其中，在中国引起辣椒枯萎病的病原菌主要为尖孢镰刀菌萎蔫专化型，在中国北京、广西和新疆等地有关于尖孢镰刀菌辣椒专化型引起辣椒枯萎病的报道。尖孢镰刀菌人工培养的适培养基为葡萄糖马铃薯琼脂培养基（PDA），培养初期该菌先生成1层白色絮状菌丝，后期逐渐产生紫色、红色、粉色或紫红色色素；菌丝生长后期形成产孢结构，即分生孢子梗，梗上形成瓶梗状产孢细胞，上着生分生孢子，分生孢子分为大型分生孢子和小型分生孢子。小型分生孢子卵圆形至椭圆形，少数略弯，0-1个分隔，无色，数量众多，多为团生，大小为（4.0-15）微米×（1.5-4.0）微米；大型分生孢子，无色或浅褐色，长而略弯，呈镰刀状，基部有足细胞，具2-6个横隔膜，多为3个隔膜，大小不等。该病菌的分生孢子梗或菌丝可直接转化形成厚垣孢子，顶生、间生或偶尔串生，短椭圆形或圆形，直径7.5-11.3微米，淡黄色或深褐色，壁厚且光滑。尖孢镰刀菌发育适温为25-30℃，在土温28℃左右时容易侵染发病，温度高于35℃或低于17℃均不利于其发育
番茄青枯病的症状主要表现在成株期叶片和茎。叶片表现为，初始顶部新叶萎蔫下垂，后下部叶片发展产生凋萎，接下来才是中部叶片产生凋萎；发病后叶片色泽较淡，呈青枯状。发病初始植株叶片白天出现萎蔫，傍晚以后恢复正常，后很快扩展至整株菱蔫，并不再恢复而。茎表现为，产生初为水浸状斑点，扩大后呈褐色1-2厘米斑块，病茎中下部表皮粗糙，常产生不定根。剖开病茎，病茎维管束变褐，横切后用手挤压可见乳白色黏液渗出，这是青枯病的典型症状。
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