在各类型棉种中，品种之间的抗性差异也很显著。值得注意的是，由于病菌存在明显的生理分化现象，不同区域的枯萎病菌其致病力不尽相同。因此，在甲地表现抗病的品种，在乙地就不一定具有相同抗性，品种的抗病性会随着种植的年限而降低，甚至丧失
土壤线虫棉田土壤中线虫的活动与消长，与棉花枯萎病的发生密切相关。线虫在土壤中的活动，可以携带棉花枯萎病菌，使之成为近距离的传播媒介。线虫在根部的过程中，造成伤口，不仅影响棉株的生长，使其抗病性降低，而且增加了病菌侵入的机会。同时，线虫的刺吸活动及分泌物，有利于病菌的繁殖，从而导致病害加重。
在寄主植物与病原物之间的相互作用中，病原物侵入寄主后产生、酶类和等物质，这些物质都会给植物造成一定的伤害。在尖孢镰刀菌致病过程中起重要作用，尤其在病菌侵入寄主后，即与细胞原生质膜的某些蛋白质结合，使膜构造发生变化，番茄炭疽病什么原因，膜结构和功能受到损伤，导致膜透性改变，电解质外漏，电导值增加以至整个植株枯萎。镰刀菌属产生的种类很多，主要是玉米赤霉烯酮、单端孢霉、镰刀菌酸和伏马菌素等
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