经过长期的探索和研究，人们仍未找到对易感品种长期有效的防治措施，研究者们一致认为，培育抗病品种才是控制香蕉尖孢镰孢菌枯萎病的根本出路。芽变选择育种香蕉长期用吸芽进行无性繁殖，与其他无性繁殖作物一样，也有芽象，因此，香蕉的芽变选种，实际上是株变选种。在病害流行的高峰期，通过大面积的田间调查，就有可能发现抗病突变体。在过去的20多年中，台湾香蕉一直遭受到FOC 4号生理小种的严重侵害，自1984年以来，采取农户举报在田间具有一定抗性的株系和组织培养筛选相结合的方法，从中选育抗性株系，对后代进行筛选，已经获得至少14个有价值的抗性品种。据统计，现在世界栽培的300多个香蕉品种中，约有一半是芽变产生的。我国短脚香蕉、高把香蕉、油蕉和仙人蕉等优良品种也是由芽变选种而来的，由此可见，芽变选种在香蕉育种中占有重要地位，是一条可行和有效的育种途径。
棉花枯萎病菌主要分布在20厘米内的土壤中，因此，深翻土壤，具有一定减轻病害的作用。棉田精耕细作，底肥充足，施肥合理，棉株生长健壮，根系发育好，抗病性增强，对控制和减轻病害具有明显作用。 [3] 棉田地势低洼，整地粗放，排水不良，土壤湿度大，不利于棉花生长，有利于病害发生和发展棉花品种棉花不同的种或品种对枯萎病的抗性表现出明显差异。一般中棉抗性较陆地棉强，木棉和海岛棉较感病。
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