病菌为菌丝体、菌核、厚垣孢子在土壤、病残体或未经高温腐熟的肥料中越冬，也可以在种子上越冬，成为第二年的初侵染源。病株茎基部表面所见粉红色霉层是病菌的菌丝体、分生孢子和厚壁孢子。该菌有较强的腐生性，在无寄主条件下，能在土壤中存活6年以上。厚垣孢子及菌核通过牲畜消化道后仍不失掉活力。所以，连作地和施用未充分腐熟有机肥的地发病重。土壤中休眠的甜瓜枯萎病菌，第2年受到瓜类蔬菜根系分泌物的刺激，可打破休眠，在适宜的温、湿度下萌发出牙管，从根部、根尖或伤口侵入，
筛选育种利用组织培养结合镰孢菌酸或FOC病原菌培养滤液筛选，可获得抗病品系。该方法主要是在离体条件下进行，一般采用分生茎尖、分生类球体或愈伤组织作为材料，以一定浓度的镰孢菌酸或FOC病原菌培养滤液作为选择压，筛选耐的突变体，李树穿孔什么原因，分化成苗后接种鉴定抗病性。该方法简化了筛选程序，缩短了选择时间，减少了人力物力的投入，大大加快了育种的进程。随着香蕉胚性悬浮培养和原生质体培养的成功，利用胚性、原生质体和体细胞作为离体诱变发生体系，将会进一步提高筛选效果。采用筛选育种是比较新的技术手段，发展潜力很大。
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