太阳能采暖的缺点就是受地区、季节、昼夜以及阴雨天等这些自然因素的影响，存在较大的不稳定性。所以说在太阳能采暖建筑中，必须借助辅助热源，保证太阳能采暖的稳定、连续的供应。辅助热源的选择是根据当地的太阳能资源以及太阳能采暖系统的工况选择的，要对当地的建筑热负荷及其环境等因素做综合性的分析来确定合适的辅助热源的。一般的辅助热源有锅炉、热泵、电热管、生物质锅炉及地源热泵等。
太阳能集热器是太阳能采暖系统的部件，常见的集热器有平板型集热器和真空管集热器。应用多、广泛的是平板型太阳能热水器。平板型集热器结构简单，不需要跟踪，成本较低，抗压，可以同时接收直射辐射和散射辐射，安装运行方面更适合与建筑结合。虽然真空管集热器的集热效果及保温效果要比平板型集热器好，但是真空管集热器价格高。冬季易冻裂等问题。在夏季，集中供热太阳能工程，过剩的热量无法储存，造成浪费。而平板型集热器则不会出现以上问题。
采用燃气炉辅助，只需把太阳能出热水口接入燃气炉进水口处即可。如果采用燃煤炉，按以上连接方法使可。目前对小面积采暖一般不采用。如大面积采暖，在有条件的地区方可采用燃煤炉辅助。
经过使用对比，目前太阳能采暖采用电加热配合使用。电加热器具有加热快，使用方便，控制简单等特点。对电加热棒的选择，单个功率低，散热电l棒长，可相对延长使用寿命，目前市场上出售的有铜和不锈钢，使用中并没有大的差异。其功率的选择，分别有4kW、9kW、10kW 和12kW，家庭一般采用220V电压为佳，要是大面积的采暖面积，需要380V电压为佳。总之要根据采暖面积大小确定，如100m2采暖面积可安装4kW~6kW 各一个即可，并可调节使用。
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