小动物CMR提供无创、高分辨率的关于心脏解剖、功能、心肌灌注和活性的信息，近年来已经越来越多的地应用于临床。同时，利用MR对小型实验动物，特别是小鼠进行心脏成像也进行了诸多的探索和应用研究，特别是(transgenic)小鼠和基因敲除(knockout)小鼠可以用来进行心脏疾病的基因和分子生物学研究。但目前常规手段，包括超声心动图、组织切片、组织化学、导管介入测量等都存在较明显的不足，这就更为小鼠CMR成像带来了广阔的应用前景。
核磁1共振成像（Nuclear Magnetic Resonance Imaging，简称NMRI），也称磁共振成像（Magnetic Resonance Imaging，简称MRI），依据所释放的能量在物质内部不同结构环境中不同的衰减，小动物PET-CT，通过外加梯度磁场检测所发射出的电磁波，即可得知构成这一物体原子核的位置和种类，据此可以绘制成物体内部的结构图像。小动物磁共振成像原理与医院临床用的磁共振原理相同，都是利用射频脉冲（Radio frequency，RF）对置于外加磁场（B0）中具有磁性的原子核，主要是氢核，进行激发产生核磁1共振信号，利用感应线圈获得与组织弛豫时间和质子密度相关的信息，通过各种编码技术和傅立叶变换终形成磁共振图像。
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