提供结构、功能信息：小动物磁共振成像除能显示组织的结构病变外，还能同时无创的进行功能成像，反映组织的不同功能和特征。例如进行磁共振波谱成像可以获得感兴趣区域内源性代谢物的信息，采用弥散张量成像可以获得脑组织中白纸纤维束的走向和完整性等信息。
对运动敏感：小动物磁共振成像对运动特别敏感，由于动物不能像人一样自主憋气，小动物PET-CT，因此在对腹部脏器如肝1脏、心脏等易受呼吸和心脏搏动影响的脏器进行检测时，需要配合使用呼吸门控和心电门控，以消除图像运动伪影。
应用案例一：
应用 7. 0T 磁共振设备，心脏磁共振成像T1 mapping技术检测2型糖尿1病小鼠早期心肌纤维化的实验研究，利用心脏电影图像后处理测量和计算获得心功能参数指标: EDV、ESV、EF 值、FS、EDAWT、EDPWT、ESAWT、ESPWT、AWT 和 PWT
应用案例二：
注射造影剂的动物的 MRI 扫描显示，与幼年动物和对照动物相比，成年动物的动脉明显变窄且 T2（1.71 倍）对比度显着升高。切除的心脏和主动脉琼脂模型在幼年动物中表现出微弱的 MRI 对比增强。
血脑屏障通透性检测
模型：8-10周pathogen-free (PF)或germ-free 1(GF)雄性小鼠
显像方式：（6.7-11MBq）11C-raclopride-PET，大200ul剂量，尾静脉注射后动态显像（30分钟）。
意义：PET动态图像显示germ-free状态下小鼠血脑屏障的通透性会增大。
疼痛研究
模型：5只（200-250g）雄性SD大鼠
显像方式：尾静脉注射（500 uCi）18F-Saxitoxin(STX)10分钟后，静态扫描10分钟。
意义：因神经性疼痛会伴随着电压门控钠离子通道蛋白（Navs）的表达上调，所以Navs的活1体PET显像为探究疼痛的深层次分子机制带来了曙光。
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