现代液相色谱和经典液相色谱没有本质的区别。不同点仅仅是现代液相色谱比经典液相色谱有较高的效率和实现了自动化 操作。经典的液相色谱法，流动相在常压下输送，所用的固定相柱效低，分析周期长。而现代液相色谱法引用了气相色谱的理论，流动相改为高压输送（高输送压力可达4.9?107Pa）;色谱柱是以特殊的方法用小粒径的填料填充而成，从而使柱效大大高于经典液相色谱（每米塔板数可达几万或几十万）；同时柱后连有高灵敏度的检测器，可对流出物进行连续检测。
液相在毛细管力的作用下流入颗粒间隙内，使颗粒重新排列以获得紧密的堆积和的孔隙总表面积，液相完全包围固相颗粒之后，液相内仍然有可能残留一些气孔。由于液相作用在气孔E的应力随孔径大小而变化，因此作用在大、小气孔上的压力差将促使液相在这些气孔之间流动，即液相黏性流动。此外，渗入颗粒间隙的液相，由于毛细管张力而产生使颗粒互相靠拢的分力。
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