骨小梁模式因子（Tb.Pf）用于形容骨小梁表面凹凸程度，其与结构模式指数（SMI），是描述小梁结构组成结构中板层结构和杆状结构比例的参数。如果结构中骨小梁主要为板层结构，那么SMI接近于0；反之，如果主要是杆状骨小梁，SMI则接近3。发生骨质疏松时，骨小梁从板状向杆状转变，该值增大。2）各向异性程度（DA）用于评价骨小梁的方向性和对称性，指椭圆体截距长度平均值（MIL）中长径和短径的比值，MicroCT颅骨，该比值越大说明各向异性程度越大。在骨质疏松早期，承重骨小梁DA值通常增加，随着骨质疏松加剧，DA会减小。3）骨小梁连接密度（Conn.D）表示每立方毫米体积中骨小梁网状结构之间的连接数量。 
micro-CT不仅能够获得比双能伦琴线吸收仪更为准确的体积BMD来反映骨量变化，颅骨MicroCT，同时还能获得骨骼内部骨小梁骨微结构的定量指标，进而将骨小梁微结构指标、皮质骨指标及骨量结合起来，综合评价骨强度和骨量在骨质疏松症发生和发展中的作用。因此，针对动物实验和人离体标本骨微结构而言，股骨头MicroCT，micro-CT在骨质疏松症、骨硬化及其他骨代谢性疾病的研究中具有重要的意义和代表性。显微CT有2 种基本结构：（1）样品静止，X射线球管和探测器运动：这种结构和临床螺旋CT一致， 球管绕样品旋转。扫描速度快，射线剂量小，空间分辨率较低，MicroCT，多用于动物扫描。（2）样品运动，X射线球管和探测器固定：样品在球管和探测器之间自旋，并可做上下和前后移动。扫描速度较慢，射线剂量大，空间分辨率高，多用于离体标本扫描。
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