在骨成像及定量分析方面的应用
显微CT成像对骨质疏松症的研究尤为重要，特别是疾病进展和治LX果，尾椎MicroCT，因为它是少数能够提供骨矿物质含量和密度信息的成像技术之一。通过高分辨率的显微CT测量这些变化，有助于开发ZL剂并理解控制这些过程的分子机制。
在环境科学的应用
鱼耳石是鱼的生命过程和环境相互作用的产物，记载了生长过程的大量环境信息，可客观记录水体环境的历史变迁及低浓度污染物的富集。
牙槽骨是指上下颌骨的不规则突起，MicroCT，是牙齿的主要支撑组织。尽管牙槽骨仅占骨骼系统的很小一部分，牙槽骨是牙齿功能的生理基础，其解剖损伤对牙周病的、正畸、种植体修复等许多具有重要意义。由于牙槽骨形态不规则，MicroCT颅骨，加之牙根的干扰，常规X射线很难分辨牙槽骨的显微结构。因此，显微CT在分析牙槽骨显微结构中起到了重要的作用，相信有显微CT的助力，将会在领域中获得越来越多的突破。
CT系统采集到图像是2D的投影图像，如果要看到空间的3D结构，必须通过重建的手段来还原。重建是一种3D图像的重塑手段，重建的尺寸大小在算法上可以人为地去设置。理论上，重建尺寸设置得越小，能得到越高清的图像，膝关节MicroCT，但是如果将重建尺寸设置的小于系统的空间分辨率，并没有意义，也不能进一步提高图像质量，只是将图像增大。所以实际上重建尺寸根据系统的分辨率以及样本扫描目的着情设置就好，比如离体样本时重建尺寸偏小设置，样本时重建尺寸可偏大设置。
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