除了结构性影像，其他的影像学都可以被称为功能影像学。脑功能成像是一种基于血氧浓度依赖性（BOLD）的脑功能成像技术，其基本原理是通过脑内血氧饱和度的改变来反映脑功能状态。按其实施方式可分为两类：静息态（Resting-state fMRI，rs-fMRI）和任务态（Task fMRI，tfMRI）。
因为动物难以完成某些具体的工作，所以在小动物中，常用的方法就是静息态的研究。所谓的静息态，就是在没有任何介入的情况下，小动物核磁共振服务，将动物放入核磁1共振仪中，对其进行扫描。目前，已有的研究主要集中在静息态，即低频段（ALFF）和局部一致性（ReHo）等。另外，基于动物静息态数据我们还可以通过计算不同脑区BOLD信号的相关系数研究大脑功能连接（Functional connection，FC)，更深层的基于功能连接的网络图还可进行图论相关指标的分析，如小世界“（small world）属性、“富人俱乐部”（rich club）等。目前，小动物核磁共振，在阿尔兹1海默症和帕金1森病等与学习记忆和认知功能障碍有关的动物模型中，应用多的小动物功能影像学。
前列1腺癌转移
模型：转基1因前列1腺癌小鼠模型。
显像方式：18F-FDG和Na18F，400μCi尾静脉注射，小动物核磁共振价格，50min后静态扫描。
意义：18F-FDG-PET成像表明Chrm高表达促进前列1腺癌肺部转移，Na18F-PET成像显示Chrm高表达促进前1列腺癌脊柱转移。
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小动物核磁1共振成像特点：
核磁1共振成像(Magnetic Resonance Imaging，MRI)是目前临床上有效的影像诊断方法之一。其具有无创、无辐射损伤、软组织分辨率高、多核多参数成像、任意层扫描等优点。对于中1枢神经系统，神经血管成像是首1选方法，特别是在其他检测方法无法识别的小的肿1瘤病变中。由于能提供高分辨率的软组织解剖图像，MRI已成为临床成像的重要工具。
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