进行μ-CT扫描的常见方法是使用传统的微聚焦X射线管。与所有X射线管一样，当高能电子在固体金属阳极中停止时，就会产生X射线：X 射线是电子在电位差作用下加速所获得的动能转化为电磁辐射的结果，肌肉含量体成分分析，这是碰撞和辐射相互作用的结果。通常会产生一束多色发散光束，并从中选择一个锥形固角。
一般来说，μ-CT系统通常采用数字平面二维探测器；常用的是电荷耦合器件 (CCD)系统，该系统使用闪烁屏，通过光纤束耦合，将X射线转换为可见光子。
近，体成分分析，基于互补金属氧化物半导体（CMOS）技术的新型探测器问世，并应用于小动物体内成像系统。下表列出了分辨率和体素尺寸小于1 μm的亚微米和纳米CT系统。
限制X射线源亮度的一个问题是阳极的热负荷，它会导致阳极局部熔化。液态金属喷射阳极（MetalJet）技术的出现解决了这一问题，活体动物骨密度和身体成分分析，该技术通过高速喷射的薄液态金属取代了传统的阳极，从而克服了这一限制（图4）。
在这种情况下，阳极的熔化不再是问题，因为阳极已经熔化。使用这些系统获得的亮度比固体阳极X射线管高一个数量级，电子束功率密度可以高出十倍，并且可以获得足够的空间相干性，从而可以使用相位衬度成像技术。
小动物双能X线（也称为双能X射线吸收法或DEXA）是一种专门设计用于临床前小动物（如小鼠、大鼠等）的成像技术。该技术结合了双能X射线的原理，通过利用不同能量的X射线束来检测和分析小动物的骨骼、软组织等身体成分。
小动物双能X线技术的主要应用场景包括：
骨密度测量：通过对小动物进行双能X线扫描，可以地测量其骨密度，从而评估骨骼健康状况。这对于研究骨质疏松症、关节炎等代谢性骨病具有重要的科研价值。
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