不管生物肥料的历史如何，微生物制剂仍继续向前发展。自20世纪80年始，人们以很大的精力关注着用于环境和农作物的生物肥料，其原因是这类产品能有效地解决存在的一些问题，特别是无公害和消除环境的污染。因此，要研制出一种既具有肥料功能，又具有消除环境污染的能力，有机菌基材，就十分困难。
在很多地方，这都是一个非常好的举措，所以，很多地方政府都会对有机肥的生产和使用给予大力的支持，甚至还从经济上进行一定不补贴，以鼓励人们使用有机肥。
人粪尿是一项重要有机肥源。平均每个成年人每年粪尿排泄量约为790公斤，有机菌基材电话，折含氮素(N)4.4公斤，磷素(P2O5)1.36公斤，钾素(K2O)1.67公斤。如以人粪收集利用率按百分之60、百分之人尿30计算，中国农村人口有9亿，折合为成年人，每年就可积攒人粪尿1600多亿公斤，可为农业生产提供氮素90万吨，磷素28万吨，钾素34万吨。
消毒房内装有脱臭塔除臭，有机菌基材造价，臭气通过塔内排出。然后将脱臭和消毒的粪便，配上必要的天然矿物，有机菌基材规格，如磷矿粉、白云石和云母粉等，进行造粒，再烘干，即成有机肥料。其工艺流程如下：粪便集中～脱水～消毒～除臭～配方搅拌～造粒～烘干～过筛～包装～入库。总之，通过有机肥的无害化处理，可以达到降解有机污染物和生物污染的目的。
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