X射线吸收法：这是一种基于不同身体组分对高/低能X射线的可变吸收率的测量技术。脂肪和肌肉对X射线的衰减存在差异，因此可以通过这种方法获得脂肪信息。该技术的优点是可以进行活体动物检测，但缺点是X射线存在辐射，实验过程存在辐射风险，且实验过程中动物需要，检测时间相对较长。
低场核磁共振技术：这是一种非侵入性的方法，非常适合于活体小动物的身体成分分析。它可以在小动物清醒、无束缚状态下快速、准确、定量地测量小动物的脂肪、瘦肉及体液含量。此外，配置成像功能的低场核磁共振技术还可用于活体小动物的体脂分布成像。这种方法无需，直接进行测试，过程方便简洁，对小鼠或小动物无任何伤害。
尽管μ-CT与普通CT在某些方面存在区别，但它们都是基于类似的原理，即利用X射线通过样品并收集多个角度的投影数据，然后使用重建算法生成三维图像。两者在各自的领域中发挥着重要作用，并且相互补充以满足不同的研究需求。
在CT扫描过程中，物体被透射几何形状的X射线照射。光束穿过物体后，由探测器收集。通常以固定的角度增量拍摄一系列二维投影。在临床CT中，光源和探测器围绕患者旋转，以产生不同的投影，而在临床前和工业应用中，光源和探测器通常是固定的，样品放在旋转台上。
第二种相互作用，双能x射线骨密度，即康普顿散射。在这种情况下，X射线光子会将电子从原子中释放出来，并在散射过程中失去部分初始能量。这种相互作用会产生一个散射光子和一个正离子。根据光子能量和样品成分的不同，光子可以偏转0到180°的任意角度。
在相干散射中，不存在电离过程。因此，散射光子与初始光子具有相同的能量。
这三种相互作用的总体结果是，穿过材料的X射线光子要么被吸收，要么被散射。散射不利于CT图像的形成，因为它会增加噪声水平。
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