氢键对许多生物分子具有重要意义。 氢也与电负性较低的元素（如活泼金属）生成化合物，这时氢的氧化态通常为 -1，这样的化合物称为氢化物。氢气生物学效应发现以来，氢气对以脑血管疾病为代表和以老年性阿尔茨海默症为代表的神经系统疾功能紊乱都具有明显的保护作用。氢与碳形成的化合物，由于其与生物的关系，通常被称为有机物，研究有机物的学科称为有机化学，而研究有机物在生物中所起的作用的科学称为生物化学。
因为严重的话，不控制好血糖，有这严重的、脏、神经的危害，有的，例如足有截肢的危险。很多动物实验表明氢气具有降低血糖的作用，在实践中很多患者吸氢气吧血糖控制的很好，吸氢几个月后血糖正常，患者往往主动告诉我们兴奋的的心情。氢气广泛用于石油工业以去除硫含量。此外，它还用于加氢异构化，其中正链烷烃转化为异链烷烃。脱芳烃将芳烃转化为环烷烃。加氢裂化将长链烃分解成短链烃。氢气广泛用于石油工业以去除硫含量。此外，它还用于加氢异构化，其中正链烷烃转化为异链烷烃。脱芳烃将芳烃转化为环烷烃。加氢裂化将长链烃分解成短链烃。
氢气分子可以进入许多金属的晶格中，造成“氢脆”现象，使得氢气的存储罐和管道需要使用特殊材料（如蒙耐尔合金），设计也更加复杂。氢气可作为飞艇、氢气球的填充气体（由于氢气具有可燃性，安全性不高，飞艇现多用氦气填充）。氢气是相对分子质量很小的物质，还原性较强，常作为还原剂参与化学反应。氢与碳形成的化合物，氢气价格，由于其与生物的关系，通常被称为有机物，研究有机物的学科称为有机化学，而研究有机物在生物中所起的作用的科学称为生物化学。
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