20世纪20年代，又有一些新的微生物制剂用于大田土壤和农作物，兵团十六团有机菌基材，但效果不甚理想。20世纪40年代，美国颁发了生物杀虫剂许可证，至今已有20多种不同的微生物产品为这一目的而使用。
1937年，有机菌基材造价，苏联微生物学家克拉西尼科夫和密苏斯金研制了“固氮菌剂”。从而了细菌肥料的先河，由于种种原因，有机菌基材图片，这种微生物肥料都先后停止了大规模生产。1940年前后，亚洲研制了一种以蓝细菌（藻类）为主而用于稻田的生物肥料。现在其在持续农业中仍然发挥着巨大的作用。
天然矿物质肥
矿物质肥，包括钾矿粉、磷矿粉、氯化钙、天然硫酸钾镁肥等没有经过化学加工的天然物质。此类产品要通过有机认证，并严格按照有机标准生产才可用于有机农业。另外值得一提的是，在补钾方面可选用取得有机产品认证的中信国安“有机天然硫酸钾镁肥”，该钾肥填补了有机天然矿物肥的国内空白，解决了有机农业补钾难的问题。
肥料处理
有机肥料无害化处理的堆、沤方法也很多，但是上海有机蔬菜肥料是采用EM堆腐法、自制发酵催熟堆腐法和工厂化无害化处理等。
EM堆腐法
EM是一种好氧和嫌氧有效微生物群，有机菌基材厂，主要由光合细菌、、酵母菌和乳酸菌等组成，在农业和环保上有广泛的用途。它具有除臭、杀虫、杀菌、净化环境和促进植物生长等多种功能。用它处理人、畜粪便作堆肥，可以起到无害化作用。
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