保护有特殊价值的自然环境，包括对珍稀物种及其生活环境、特殊的自然发展史遗迹、地质现象、地貌景观等提供有效的保护。另外，城乡规划，控制水土流失和沙漠化、植树造林、控制人口的增长和分布、合理配置生产力等，也都属于环境保护的内容。环境保护已成为当今和人民的共同行动和主要任务之一。中国则把环境保护宣布为中国的一项基本国策，深圳河道治理，并制定和颁布了一系列环境保护的法律、法规，以保证这一基本国策的贯彻执行。
酸碱类污染物指标。酸性、碱性废水破坏水体的自然缓冲作用，河道治理施工组织设计，妨碍水体的自净功能。pH值是检测水体受酸碱污染程度的一个重要指标。氮、磷类污染物指标。氮、磷、钾、硫等化合物是农作物生长需要的宝贵营养物质，但过多的营养物质进入天然水体，将恶化水质，形成污染，严重时使水体形成富营养化。水生生物所需要的营养物质是多种的，其中氮、磷是藻类生长的控制元素，故常用限制氮、磷元素含量的办法来控制水体富营养化的速度。重金属指标。从环境方面而言，重金属主要指、镉、铅、铬以及类金属等生物毒性显著的元素，称为“五毒”。病原微生物指标。病原微生物是指进入水体的病菌、病毒和动物寄生物。用作水体水质病菌指标的是大肠菌群。
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