常见的生物切片，厚度一般在几微米的程度，这种厚度制作起来比较简单，除了可以使用自动化的设备来切片之外，手动操作也能切到这种厚度，而且完够满足光学显微镜下观察的标准。不过在前沿的科研领域里，需要观察更细微的细胞结构，甚至需要从分子的层面来进行研究，这时候就需要用到电子显微镜。然而电子显微镜也需要更薄的样品，切片至少要达到0.1微米的厚度，而这种切片也就被称为是超薄切片，在很多实验研究里需要厚度达到50纳米，显然手I操作是无法达到这种厚度的。那么在实验环境下是怎样做成这种超薄生物切片的呢?首先是需要进行更好的固定，因为在如此薄的尺度之下，不但基本的细胞结构都已经被完全破坏，而且其中的细胞器也都被切开，里面的生物酶会释放出来，并且在很短的时间内使细胞结构遭到破坏。所以就需要在取得样品之后尽快进行固定，要求在一-分钟之 内完成这项操作，然后再使用对应的材料来做透明化以及包埋，接下来还需要配合的切片机来完成切片的过程，从而达到理想的厚度。
HE染色是制作切片过程中较为常用的染色方法之一，细胞核被苏染成鲜明的蓝色，基质、钙盐颗粒呈深蓝色，粘液呈灰蓝色。细胞浆被伊红染成深浅不同的粉红色至桃红色，胞浆内嗜酸性颗粒呈反光强的鲜红色。胶原纤维呈淡粉红色，弹力纤维呈亮粉红色，红血球呈橘红色，蛋白性液体呈粉红色。着况与组织或细胞的种类有关，也随其生活周期及病理变化而改变。例如，细胞在新生时期胞浆对伊红着色较淡或轻度嗜碱，植物硬组织切片，当其衰老时或发生退行性变则呈现嗜伊红浓染。胶原纤维在老化和出现透明变性时，伊红着色由浅变深。
病理切片是一种特殊的小玻璃，是患者病历信息的常规存储介质，承载所有病理组织信息。其原理是取下疑似病变的组织或细胞，经过一系列处理后切成薄片，贴在玻璃上，染色，在显微镜下目测。病理切片是患者病例数据的重要组成部分，可以永1久保存。当疾病复1发或进展时，可再次复查病理切片，并与进展后的病情进行比较，以达到区分疾病性质和分类的目的。
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