分子病理学是20世纪70年代初，水稻原位杂交技术服务，随着疾病的细胞生物学和分子生物学的发展和相互渗透的一个病理学分支学科。分子病理学是应用分子生物学理论、技术和方法，研究疾病发生1发展过程中蛋白质和核酸水平变化对疾病发生过程的影响及其作用，探讨疾病发生的分子机制，揭示疾病本质的现代病理学的分支学科。深入进行疾病分子病理学研究，将为疾病的精1准诊断和精1准治1疗提供重要的科学依据。
分子病理应用的检测样本主要包括石蜡组织、新鲜组织、脱落细胞、全血及其他体液等。石蜡切片标本厚度应在4-6μm，切片数量依据组织大小而定。样本质量对检测结果和分析至关重要，病理医师需要对可评估的样本进一步明确病理诊断，并评价标本有无出血、坏死和不利于核酸检测的前处理(例如含HCl脱钙液处理)，病变细胞(如细胞)的总量和比例，避免假阴性。进行NGS检测前需通过病理诊断明确其的性质及含量，根据不同类型选择合适的基因panel测序。组织标本中细胞含量建议达到20%以上，低于此标准可富集后检测。未经病理评估的基因检测结果不可单独用于分子病理临床诊断目的。
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