现代物流的管理，涉及计划、经贸、财税、工商、内贸、外贸、铁道、交通、民航、邮政、信息、海关、质检等多个部门；现代物流的运作横跨不同的行业和地区，必须协调动作，形成合力。物流必然和多个部门有关，在日本经济产业省设立专门机构物流科负责协调政策管理，我国如果在当前机构改革中明确设立物流部门，对于物流现代化的推进必然具有重大意义。各级都应该加强对发展现代物流的统一领导，建立必要的部门间的综合协调机制，汽车运输厂家，负责研究、制定发展现代物流的规划，并负责协调现代物流发展中的相关政策措施，为构建统一、的现代物流体系创造体制环境。
信息系统之间缺乏接口标准，工商企业内部物流信息系统与第三方信息系统之间缺乏有效衔接，运输信息系统、仓储信息系统、物流作业管理信息系统之间互不沟通，汽车运输，由于没有公共物流信息交流平台，以EDI互联网等为基础的物流信息系统难以得到实际应用。
在计划经济体制下，各个行业从上到下一统到底，行业之间、部门之间管理体系分割现象严重，在向市场经济转型的过程中，习惯势力仍然有一定影响。物业的发展涉及到基础设施、物流技术设备、产业政策、投资融资、税收、海关、服务、与运输标准等多个方面，而这些问题的管理分属于不同的职能部门，各职能部门对现代物流认识不足和缺乏统一协调的战略思想，成为物业发展的主要瓶颈之一。
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