税收要鼓励物流业务的整合，提升物流企业的供给能力。现行税收政策的某些方面对于物流行业发展有制约作用。应该利用的管理技术和信息系统对传统的物流资源进行整合。但在实践中由于物流总代理商首先一票对客户，然后转包业务(如仓储、运输)到各合作单位时，存在重复纳税的问题，影响了总代理商整合业务的开展。说明税收制度不利于物流的“集零为整”。物流不整合就不能降低成本、提益。
能够适应多组织架构物流公司的管理和多仓库统一管理的要求；能够满足多货主的不同备件保税或完税物流管理的需求；能够满足货主业务发展的需要，汽车运输公司，进行不同区域的快速配送服务；能够快速调整和适应因货主备件物流管理过程的变化要求；能够对协作的承运商进行管理，汽车运输企业，包括费用的按期结算；能够设定各种物流费用（包括各种关税和海关代收增值税），系统按业务量自动结算物流费用和各种税收，也可手工调整和补录特殊费用；
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