控制洁净车间的全过程实质上就是围绕控制产尘和有效排尘两环节对微尘实施的的全控制。洁净车间的环境包括洁净车间的结构、墙壁材料、水系统、空调洁净系统等。经过验证的空调洁净系统， 在正常工作的情况下能满足洁净度的要求。空调洁净系统所形成的微尘分为两种:一种是系统运行客观上造成的微尘， 另一种则是控制因子未达标。
洁净室运行中存在的问题
①洁净室内布局不合理
②洁净室的清扫工作不规范
③在对一些洁净室的局部单向流进行风速及洁净度测试时，手术室无尘净化车间设计，经常会遇到同一局部百级区域某些位置的风速很小，几乎为零，且洁净度也经常超标。
净化工程按照字面解释就是帮助我们更多的净化下我空气环境，百度给出的净化工程是指控制产品 (如硅芯片等) 所接触大气的洁净度及温湿度，使产品能在一个良好的环境空间中生产、制造。此环境空间的设计施工过程即可称为净化工程。
净化工程中各级空气洁净度的空气净化处理，手术室无尘净化车间安装，均应采用初效、中效、空气过滤器三级过滤。100000级空气净化处理，手术室无尘净化车间施工，可采用亚空气过滤器代空气过滤器。
生物制药常见问题及处理技巧：
排风系统设备
净化工程车间内排风系统的风管、调节阀和止回阀等附件的制作材料和涂料，应根据排除有害物的性质及其所处的空气环境条件确定。排除腐蚀性气体的风管可采用塑料风管。排风管穿过防火墙处，诸城手术室无尘净化车间，应设置防火阀。
含有、物质的局部排风系统，应有相应的防火、防爆措施，如选用防爆风机等。要特别注意药厂排风系统的排风口和空调系统的新风采气口保持足够的水平距离及高差。青等强致敏性、某些甾体、高活性、有的排风口应装置高效空气过滤器，使这些引起的污染危险降低到蕞低限度。其排风口与其他操作空调系统的新风口之间，更应保持一定距离。
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