除人工清洗外，船舶还可以通过添加剂逐步清洗HSFO油舱和燃料系统中的沉淀物和沥青质污泥，这种方法相对安全且简单，可以为船舶节省很多时间成本和经济成本。由于清洗油舱所以污水含有色度，游轮清洗价格，所以洗舱污水在处理时就需要用到水处理药剂-脱色剂。指南中重要的一个技术环节就是关于船舶在开始使用含硫量低于0.50%m/m的合规燃油前的燃油舱清洗问题。
目前大多数船舶使用的仍是高粘度高硫燃料油(HSFO)，大游轮清洗，此类燃料油会粘附在油舱内壁上，芜湖游轮清洗，非常难清洁。由于清洗油舱所以污水含有色度，所以洗舱污水在处理时就需要用到水处理药剂-脱色剂。每艘船完成清洗和冲洗需要的时间大约为1-2周。经过上述清洗和冲洗的油舱和管路，在接收合规的燃油后，基本可以满足公约的排放要求。
港口码头仓储企业主要储存油品、化工品、液化烃等。该港口企业的日均废水排放量就很大，废水毒性大，有机物种类繁多，清洗游轮油舱，生物降解性差。船舶进入船坞进行燃油舱清洗所需要的时间因船而异，但一般来说每个燃油舱清洗的平均耗时为2-4天，再加之对船舶燃油系统管路的冲洗。在2020年1月1日之前，大部分使用HSFO的船队都不可能在很短的时间内进行干船坞检查、清洁。
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