现代物流的管理，涉及计划、经贸、财税、工商、内贸、外贸、铁道、交通、民航、邮政、信息、海关、质检等多个部门；现代物流的运作横跨不同的行业和地区，必须协调动作，大件物流运输方式，形成合力。物流必然和多个部门有关，在日本经济产业省设立专门机构物流科负责协调政策管理，我国如果在当前机构改革中明确设立物流部门，对于物流现代化的推进必然具有重大意义。各级都应该加强对发展现代物流的统一领导，大件物流运输服务，建立必要的部门间的综合协调机制，负责研究、制定发展现代物流的规划，并负责协调现代物流发展中的相关政策措施，为构建统一、的现代物流体系创造体制环境。
服务功能的单一，大件物流运输公司，增值服务的较少，同质化竞争现象较为严重。大部分跨境物流企业只能提供海运物流或者空运物流服务，能提供多式联运(如海空联运)和满足客户其他不同需求的跨境物流企业较少；在提供跨境物流服务时，局限于报关、订舱等传统服务，在提供运输方案优化设计、综合物流服务方面较少，因此同质化竞争现象较为严重。
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