






亚细胞定位的应用实例:
蛋白质亚细胞定位预测算法:王艺皓等人提出了一种基于堆栈式降噪自编码器(SDAE)深度网络的蛋白质亚细胞定位算法。该算法首先对蛋白质序列进行特征提取并融合,然后输入到 SDAE 深度网络自动学习更有效的特征表示,后选用 Softmax 回归分类器进行亚细胞的分类预测。实验结果表明,该算法可以有效提高蛋白质亚细胞定位预测的准确性。
不同亚细胞定位的蛋白质在细胞生理过程中的具体协同作用有哪些?
蛋白质在细胞内的不同亚细胞定位对细胞生理过程起着至关重要的作用。不同定位的蛋白质之间往往存在协同作用,共同维持细胞的正常生理功能。以下将详细阐述不同亚细胞定位的蛋白质在细胞生理过程中的具体协同作用。
一、核质间的协同作用
BRCA1 基因编码的蛋白质 BRCA1 是一种抑制蛋白,具有多个蛋白质相互作用结构域,在调节 DNA 修复和维护、细胞周期进程、转录以及细胞存活 / 凋亡等方面发挥重要作用11。BRCA1 含有核输出和核定位信号等不同的运输序列,能够在细胞核与细胞质特定位点之间穿梭,包括 DNA 修复焦点、中心体和线粒体等。BRCA1 的核运输和泛素 E3 连接酶酶活性受到其二聚体结合伙伴 BARD1 的严格调控,并进一步受到突变和多种信号通路的调节。这表明 BRCA1 在细胞核与细胞质之间的穿梭及其与不同蛋白质的相互作用,在细胞生理过程中发挥着重要的协同作用。例如,在 DNA 修复过程中,细胞核中的 BRCA1 可能与细胞质中的某些蛋白质协同作用,蛋白免疫定位,共同确保 DNA 修复的准确性和性。

相关数据库
SUBA:主要聚焦于植物蛋白质的亚细胞定位信息,为研究植物细胞内蛋白质的分布和功能提供了丰富的数据资源。
Cell-PLoc:提供了多种生物蛋白质亚细胞定位的预测和注释信息,涵盖了细菌、真菌、动物和植物等多个物种。
Human Protein Atlas:专注于人类蛋白质的亚细胞定位数据,通过多种实验技术和方法,系统地对人类蛋白质在细胞内的位置进行了标注和展示。

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