较多的接种菌液可大大缩短启动所需的时间，但过多的接种污泥量没有必要。一般说来，厌氧污泥购买，用处理同样性质废水的厌氧反应器污泥作种泥是有利的，但在没有同类型污泥时。不同的厌氧污泥同样对反应器的启动具有一定的影响，没有处理同样性质废水的厌氧反应器污泥作种泥时，厌氧消化污泥或粪便可优先考虑。颗粒污泥在各方面的性能都明显优于絮状污泥，还对颗粒污泥的物理特性及保存方式进行了初步研究.=。
除此以外 ，微量元素对微生物良好生长也有重要的作用。以甲1烷菌为例来说，厌氧污泥，甲1烷菌需要相对高浓度的Fe、Co、Ni等 ，而在某些废水中不含有或含有的浓度非常低。在此情况下 ，只有向废水中补充这些微量元素。已在进水合成基质成分的试验中 ，添加过Fecl2?4H2O ，厌氧颗粒污泥厂家，CuCl2 等物质。不过 ，具体要添加哪种微量金属溶液 ，厌氧颗粒污泥，还要依据进液废水的情况而定。
中温稳定运行时，颗粒污泥规 则、密实，微生物菌群中甲1烷八叠球菌明显增多。低温时，颗粒污泥的表面和内部微生物排列都比较松散，而且出现大量微生物胞外分泌物;低温中高浓度时，甲1烷八叠球菌没有出现，鬃毛甲1烷菌属占优势。微氧时颗粒污泥同样是规则、密实的，菌1种更加丰富，颗粒表面和内部的优势菌群不同，但在中高浓度时没有出现甲1烷八叠球菌的明显优势。
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