仪器中间状态检查
仪器状态直接影响到分析物的检测限、定性与定量，除了按照规定的周期进行计量检定外，还应该定期进行期间核查，根据仪器使用情况可每季度或每月核查一次。气质联用仪期间核查的内容可包括:仪器检测限(灵敏度)、分析物保留时间的重复性(稳定性)、数据的精密度、线性范围等几个方面。可通过系列浓度的有证标准物质溶液重复进样进行验证，质谱部分还可通过观察校正气FC43的特征离子是否正常确认仪器是否需要校正。通过核查证明仪器状态良好时才能进行样品分析。
气相色谱质谱联用仪的维护
1、开机和关机
开机时先开GC，后开质谱，设定合适的离子源温度和传输线温度，不要忘记打开真空补偿，国产GC-MS厂家，否则真空难以达到50mTorr以下。关机前关闭传输线温度，离子源温度需降至175℃以下，等待分子涡轮泵转速降下来后，仪器会提示“OKtoturnoffpower”，此时方可关闭电源。
2、实验前需先确定
(1)离子源是否到达特定温度，一般推荐使用250℃；(2)当柱流速为1ml/min时，前极压力正常在30到50mTorr之间；(3)打开灯丝看空气/水的背景，确认真空没有泄漏。
气相色谱质谱联用仪的数据处理
1 接通电源开关 全部指示灯点亮约需1秒钟，其后，国产GC-MS，指示灯的闪烁约持续30秒钟.其间，如果没有不良情况，READY的指示灯点亮.
2 设定记录器的灵敏度 如设定灵敏度为8时：ATTEN 3 ENTER（对照表见说明书31页）.设定送纸速度10：
SPEED 10 ENTER.
3 划出色谱仪的基线 操作SHIFT DOWN PLOT ENTER键，一直等到色谱仪的基线稳定为止. 再一次操作SHIFT DOWN PLOT ENTER键，国产GC-MS生产厂家，则作图停止.
4 打印色谱仪的零点的偏离（单位：uV） 按动PRINT键，再按着CTRL键，按动LEVEL键.放开LEVEL键后，再放开CTRL键.接着按动ENTER 键（注意：CTRL键必须比目的键LEVEL先按，比目的键后放开）.
5 调整色谱仪的零点，使之进入-1000uV到+5000uV之间的范围.反复进行4～5项操作.
6 记录笔移至原点 操作ZERO ENTER键.
7 进样分析 在色谱分析仪中注入试样，同时按动START键.
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