原位杂交技术（in situhybridization）是以标记的核酸分子为探针，在组织细胞原位检测特异核酸分子的技术。使含有特异序列、经过标记的核酸单链即探针，在适宜条件下与组织细胞中的互补核酸单链即靶核酸发生杂交，再以自显影或细胞化学方法对标记探针进行探测，荧光原位杂交，从而在细胞原位显示特异的DNA或RNA分子。
可以检测cRNA、miRNA、LnRNA、DNA。可以各种种属的标本，包括哺乳动物、爬行动物、菌、植物标本。也可以检测组织芯片。
原位杂交是一种强大的技术，它使研究人员能够在细胞或组织中确定特定DNA或RNA序列的位置。这项技术在基础研究和临床应用中都有广泛的应用。通过了解原位杂交的基本原理和实验步骤，研究人员可以更好地理解其功能并应用于他们的研究中。
原位杂交技术的定义和基本原理原位杂交技术是一种基于核酸分子杂交原理，将标记的核酸探针与生物组织或细胞中的DNA或RNA进行特异性结合，从而在细胞水平上检测目标核酸序列分布的技术。原位杂交技术的基本原理是利用DNA或RNA的互补性，通过加热或化学反应使探针与组织或细胞中的目标核酸序列形成双链复合物，进而实现目标核酸序列的定位。
荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization，FISH）是在20世纪80年代末在性原位杂交技术的基础上发展起来的一种非性分子细胞遗传技术，以荧光标记取代同位素标记而形成的一种新的原位杂交方法，探针首先与某种介导分子（reporter molecule）结合，杂交后再通过细胞化学过程连接上荧光染料.FISH的基本原理是将DNA（或RNA）探针用特殊的核苷酸分子标记，然后将探针直接杂交到染色体或DNA纤维切片上，再用与荧光素分子偶联的单与探针分子特异性结合来检测DNA序列在染色体或DNA纤维切片上的定性、定位、相对定量分析.FISH具有安全、快速、灵敏度高、探针能长期保存、能同时显示多种颜色等优点，不但能显示中期分裂相，还能显示于间期核.同时在荧光原位杂交基础上又发展了多彩色荧光原位杂交技术和染色质纤维荧光原位杂交技术.
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