定期清洗船舶燃油舱安全有效的方法是安排船舶进坞检查和清洗，短期内安排所有正在使用HSFO的船舶进船坞清洗燃油舱并不现实。如果雇佣工程队轮流清洗，则每个油舱至少需要2天，船只油舱清洗，同样为周全考虑，燃油舱 清洗，好为每个油舱预留出4天时间。形成含有沉淀物和沥青质污泥的半固态物质层，还会沉淀在燃油管路及沉淀柜和日用柜中。
如果船舶在营运过程中安排人工清洗油舱，船长应首先考虑到人员进入密闭舱室的安全问题。提前预订添加剂，电子油舱清洗，并确保计划执行燃油舱清洁的轮机长和轮机员知道如何正确使用添加剂。与租家及时沟通，芜湖油舱清洗，为聘请工程队清洗合理安排好船期。进入程序必须遵守国际海事组织第A.1050(27)号决议关于《进入船上密闭舱室的建议案》中的安全措施。
残留物通常也会凝固并沉淀在燃油系统的各个部分，包括管道、沉淀柜和日用柜。每艘船完成清洗和冲洗需要的时间大约为1-2周。经过上述清洗和冲洗的油舱和管路，在接收合规的燃油后，基本可以满足公约的排放要求。船东需要考虑使用其他的替代方法进行燃油舱和管路的清洗。目前除了进船坞清洗外，还有在营运期间清洗及使用添加剂进行清洗两种办法。
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