EO在消毒领域；EO在消毒与灭菌中的应用已久，是迄今为止得到全世界公认的可靠化学气体灭菌剂。过去EO主要用于工业规模的消毒与灭菌，随着现代工业技术和自动化、智能化技术的发展，环氧乙烷制备，已经使得EO灭菌技术可以安全地用于机构不耐高温、高湿的精密的灭菌。EO是继甲醛之后出现的第二代化学消毒剂，至今仍为好的冷消毒剂之一，也是目大低温灭菌技术（低温等离子体、低温甲醛蒸汽、EO、）的一员。
灭菌物品装载: 灭菌柜内装载物品上下左右均应有空隙(灭菌物品不能接触柜壁)，物品应放于金属网状篮筐内或金属网架上；物品装载量不应超过柜内总体积的80%。灭菌处理: 应按照灭菌器生产厂家的操作使用说明书的规定执行；根据灭菌物品种类、包装、装载量与方式不同，选择合适的灭菌参数。1)浓度、温度和灭菌时间的关系: 在一定范围内，温度升高、浓度增加，可使灭菌时间缩短。在使用灭菌时必须合理选择温度、浓度和时间参数。
中型灭菌器：一般用于一次性使用诊疗用品的灭菌。这种灭菌设备完善，自动化程度高，环氧乙烷厂家，可用纯或和二氧化碳混合气体。一般要求灭菌条件为：浓度，800 mg/L～1000mg/L，温度，环氧乙烷，55℃～60℃，相对湿度60%～80%，作用时间6 h。灭菌完成需抽真空。灭菌物品常用可透过的塑料薄膜密闭包装。如果在小包装上带有可过滤空气的滤膜，则灭菌效果更好。
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