在分析蛋白亚细胞定位时，需要考虑多种因素，如蛋白质的结构、序列、修饰等。不同的蛋白质在细胞内的位置可能不同，例如有些蛋白质可能定位于细胞质、细胞核、线粒体、叶绿体等不同部位。同时，同一个蛋白质在不同细胞类型或不同生理状态下也可能有不同的亚细胞定位。因此，在进行蛋白亚细胞定位分析时，双分子荧光互补，需要考虑多种因素的综合影响。
蛋白亚细胞定位的研究成果对于了解细胞的生命活动和调控机制具有重要意义，也为疾病诊断和提供了重要的参考依据。因此，开展蛋白亚细胞定位分析和预测服务，对于生物学、医学、生物信息学等领域的发展都具有重要的意义。
蛋白质序列特征：
利用改进型伪氨基酸组成法（PseAAC）、伪位置特异性得分矩阵法（PsePSSM）和三联体编码法（CT）对蛋白质序列进行特征提取，并将这三种方法得到的特征向量进行融合，以得到一个全新的蛋白质序列特征表达模型，然后输入到堆栈式降噪自编码器（SDAE）深度网络里自动学习更有效的特征表示，选用 Softmax 回归分类器进行亚细胞的分类预测，可有效提高蛋白质亚细胞定位预测的准确性。
利用 PSI-BLAST 工具搜索蛋白质序列，提取位点特异性谱中的位点特异性得分矩阵作为蛋白质的一类特征，并计算 4 等分序列的氨基酸含量以及 1～7 阶二肽含量作为另外两类特征，由这三类特征一共得到蛋白质序列的 12 个特征向量。通过设计一个简单加权函数对各类特征向量加权处理，作为神经网络预测器的输入，可提高蛋白质亚细胞定位预测的精度。
基因法转化洋葱表皮细胞：
分别用70%乙醇和灭菌蒸馏水清洗金粉（直径为1 μm），加入灭菌蒸馏水制成金粉悬浮液，取100 μL 放在含有1.0 cm2 洋葱表皮的玻璃皿中，边振荡边加入10 μL pCambia2301-GaMYB2-GFP质粒，逐步加入40 μL 0.1 mol·L-1 亚精胺和100 μL2.5 mol·L-1 CaCl2，振荡混匀。基因GDS-80轰击时氦气罐的气压为1 300 psi，取10 μL DNA 包裹好的微粒悬浮液加到基因中央，进行轰击，之后放置25℃避光过夜培养，使用ConfocalLaser激光共聚焦显微镜观察。
湖北双分子荧光互补-贝科新肽科技公司由武汉贝科新肽科技有限公司提供。武汉贝科新肽科技有限公司是湖北 武汉 ,化学试剂的见证者，多年来，公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针，满足客户需求。在贝科新肽领导携全体员工热情欢迎各界人士垂询洽谈，共创贝科新肽更加美好的未来。