如果船舶在船坞中仅仅清洗了燃油舱，而没有进行管路冲洗，船舶在接收完合规燃油后仍需要2-5天的时间来冲洗燃油系统管路以达到排放要求。指南中重要的一个技术环节就是关于船舶在开始使用含硫量低于0.50%m/m的合规燃油前的燃油舱清洗问题。形成含有沉淀物和沥青质污泥的半固态物质层，还会沉淀在燃油管路及沉淀柜和日用柜中。
在2020年1月1日之前，清洗邮轮内胆，大部分使用HSFO的船队都不可能在很短的时间内进行干船坞检查、清洁。港口码头仓储企业主要储存油品、化工品、液化烃等。该港口企业的日均废水排放量就很大，废水毒性大，邮轮清洗公司，有机物种类繁多，邮轮清洗船底，生物降解性差。在2015年，IMO实行排放控制区（ECA）内使用0.10%m/m含硫量上限的规则生效后，芜湖邮轮清洗，已经有很多船舶采用添加剂的方式清洗燃油舱成功的案例。
清洗过程中也可以同时检查油舱结构、加热系统以及进行压力测试等。限硫令生效后，预计大多数船舶将使用含硫量低于0.50%的馏分燃料，但是目前大部分船舶一直在使用高粘度高硫燃料油。如果船舶在船坞中仅仅清洗了燃油舱，而没有进行管路冲洗，船舶在接收完合规燃油后仍需要2-5天的时间来冲洗燃油系统管路以达到排放要求。
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