与扫描电镜不同，TEM需要将样品制备成超薄切片（厚度通常为50~100 nm）或直接将纳米级样品吸附在载样网上，确保电子束能够穿透样品。对于外泌体样品，通常采用负染法或正染法进行染色处理，以增强样品与背景的对比度，便于观察外泌体的形态和结构——负染法是利用高电子密度的重金属盐（如磷钨酸、醋酸铀）包裹外泌体表面，使背景呈现深色，外泌体呈现亮白色的“亮核暗晕”形态；正染法则是让重金属盐渗透到外泌体内部，使外泌体呈现深色的“暗核亮背景”形态，两种染色方法各有优势，可根据研究需求选择使用。
外泌体作为细胞分泌的纳米级脂质双层膜囊泡，广泛参与细胞间通讯、物质运输及信号传递，在生理病理过程中发挥关键作用，其形态学特征、结构完整性及功能关联性的研究已成为生命科学、医学诊断及研发领域的热点方向。电子显微镜（简称电镜）技术凭借其纳米级的超高分辨率，能够直观呈现外泌体的大小、形态、膜结构及内部成分，是外泌体鉴定、表征及机制研究的工具。
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