产品检测效能低由于食品的特殊性，特别是预包装食品，检测后就会失去食用价值，因此只能依靠抽样检测结果来推断其总体水平。这样就会存在抽样误差的问题，特别是目前我国的初级农产品，由于分散式种、养，一个样品并不一定具备代表性。例如对猪肉中进行抽样检测，如果这些猪是从不同养殖户那分散收购的，那么抽样检测几乎没有意义，即使抽样率为90%，合格率是100%，也不敢肯定剩下的10%一定没有问题，这样就会使检测的效能大大降低。
食品中的有害物质的检测是保证食品安全的重要手段。在旧时代，我国人民吃不饱，食品安全问题也没有被关注。但在当今，随着国家经济的发展，我国国民收入也越来越高，生活越来越好，对食品的要求也越来越高。然而我国一些在食品中造假，食品检验检测机构，越来越多有毒有害的食品被端上了餐桌，如苏丹红、、。这些食品安全问题已经引起了广大人民的愤怒，食品检验技术，食品中的有害物质的检测是保证食品安全的重要手段。
食品质量安全一直是国家的难点问题，食品检验，虽然不断加大了惩处力度，但还是难以做到，原因在于：，食品生产商家不计其数，食品种类繁多，并且还有很多家庭作坊式的食品加工厂。第二，食品检验标准，许多不法商家为了牟取利益，经营的食品生产作坊经常是刚打击、关停、取缔一批，又会有新的一批出现。因此，食品安全管理部门对生产食品的行为难以做到，而不清洁、不卫生的食品生产作坊生产出来的食品存在很大的安全隐患。
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