






山东大学微生物技术国家重点实验室李越中/吴长生团队与张伟合作在国际期刊《ACS central science》上发表题为“Deciphering The Biosynthesis and Physiological Function of
5-Methylated Pyrazinones Produced by Myxobacteria”的研究,山东大学为完成单位和通讯作者单位。贝纳基因为该项研究提供了细菌基因组测序服务。
黏细菌是一类重要的药源微生物,能产生结构复杂且生物活性突出的次级代谢产物。作者从一株稀有黏细菌Corallococcus exiguus SDU70中发现了一类5-吡嗪酮类化合物coralinone,通过体外酶反应、基因敲除等实验解析了其生物合成途径,三代基因测序,并发现coralinone能促进液体培养时菌体的凝集。
Q1:什么是泛基因组?
泛基因组(Pangenome)指一个物种中全部基因组信息的综合体,包含所有个体的“基因组”(所有个体共有)和“可变基因组”(仅部分个体拥有)。泛基因组的构建揭示了物种内部的遗传多样性,为深入理解基因功能、变异与适应性提供了更完整的参考框架。
Q2:为什么需要构建动植物的泛基因组?
动植物群体中存在丰富的基因组结构变异(如大片段缺失、倒位、基因拷贝数变化等),这些变异往往与性状、适应性或进化相关。单一参考基因组难以代表整个物种的多样性,构建泛基因组能更真实地反映种内遗传多样性,支持作物改良、物种进化及生态适应性研究。
基因组在科研中的主要应用场景有哪些?
T2T 基因组的高完整性和高精度,使其在多个研究方向中具有广泛应用价值。例如:
· 基因功能解析与结构变异研究:帮助识别此前遗漏或错误注释的基因和变异位点;
· 染色体结构与基因调控研究:为端粒、着丝粒以及重复区的表观调控与结构动力学分析提供模板;
· 比较与进化基因组学:可作为高质量参考用于不同物种或群体间的比较,揭示基因组演化模式;
· 医学与人类遗传学研究:助力发现与疾病相关的复杂变异及结构重排。
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