BSA性状定位，针对目标性状，选取表型差异的亲本构建家系，并采用混池分组分析法(Bulk Segregant Analysis，BSA)进行性状定位。通过对表型子代分别构建的两个样本池及亲本进行测序，检测与目标性状相关的遗传变异，并进行功能注释，从而解析控制该性状的关键基因及其调控机制。
GWAS，基于全基因组重测序技术，通过对自然群体或种质资源中的个体进行基因组测序，并结合目标性状的表型数据，利用统计模型分析基因型与表型之间的关联，挖掘控制目标性状的关键基因或染色体区段。GWAS无需构建特定的群体，能够解析复杂性状的遗传基础，全基因组重测序，特别适用于多基因控制性状的研究。该方法因其“遗传背景丰富、变异检测、适用性广泛”的优势，已广泛应用于作物改良、动物育种及人类疾病研究。
1. 全长lncRNA测序，全长IncRNA测序是指无需对去除rRNA后的RNA进行打断，直接获取逆转录cDNA的5’端到3’端全长序列。不依赖于Poly(A)尾富集，同时对含有Poly(A)尾和不含有Poly(A)尾的IncRNA转录本进行鉴定和定量，并系统的进行可变剪切分析。应用于发育生物学、学研究、免疫、环境毒理研究等。
2. TAIL Iso-seq，基于三代ONT测序的TAIL Iso-seq可以准确量化转录本的Poly(A)尾长度，同时分析可变剪接、融合基因、鉴定新异构体，定量转录本表达水平，深度解析Poly(A)尾在基因表达调控中的作用。主要应用于功能基因组、生长发育、作物防御、作物遗传改良、林木遗传育种、环境适应、免疫反应、动物育种、疾病/发展。
基于泛基因组，研究团队发现病抗性基因座a(Mla)在品种RGT Planet中存在一段长度为40K、包含两个Mla基因家族成员的区域，并且被头对尾地重复了四次。然而在泛基因组中的62份材料中，这段区域即使是一个完整的Mla拷贝也不存在，但其中存在149个与Mla核苷酸相似度达到98%的高度相似的同源基因。研究团队提出，这种结构复杂、包含多个同源抗性基因的基因座如何改变种序列的多样性导致基因拷贝数的改变与病或其他疾病的抗性变化。
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