






基因转录受DNA化和染色质可及性的共同调控
WGBS、ATAC-seq 与RNA-seq联合分析表明,染色质可及性与基因表达正相关,高表达基因启动子区域染色质可及性更高。联合分析在两个品种中分别鉴定出91个和 22 个受 DNA 化和染色质可及性共同调控的差异表达基因,主要参与基本生物过程。eQTM 和 EWAS 分析显示,DNA 化在调控基因表达和植物生长中具有重要作用。
1. Direct IncRNA测序, 基于ONT三代测序平台,可直接读取完整的天然RNA分子,无需逆转录和PCR扩增,能同步检测lncRNA,mRNA,rRNA,tRNA等多种RNA类型,在单碱基水平直接鉴定多种RNA修饰位点(如:m6A、m5C、假尿苷ψ、肌苷和2-O-化等),同时解析新转录本、可变剪接,融合基因,APA及Poly(A)尾长等转录本结构信息。

山东大学微生物技术国家重点实验室李越中/吴长生团队与张伟合作在国际期刊《ACS central science》上发表题为“Deciphering The Biosynthesis and Physiological Function of
5-Methylated Pyrazinones Produced by Myxobacteria”的研究,山东大学为完成单位和通讯作者单位。贝纳基因为该项研究提供了细菌基因组测序服务。
黏细菌是一类重要的药源微生物,二代基因测序,能产生结构复杂且生物活性突出的次级代谢产物。作者从一株稀有黏细菌Corallococcus exiguus SDU70中发现了一类5-吡嗪酮类化合物coralinone,通过体外酶反应、基因敲除等实验解析了其生物合成途径,并发现coralinone能促进液体培养时菌体的凝集。
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